Kursplan för Introduktion till bioinformatik

• Förklara hur bioinformatik och storskalig molekylärbiologisk data kan användas för att lösa biologiska problem.
• Förklara fördelarna och nackdelarna med de olika metoderna för storskalig DNA- and protein-sekvensering samt deras tillämpningar inom genomiken.
• Beskriva och tillämpa metoder för analys av sekvensdata.
• Beskriva metoder för att anpassa sekvenser med syfta att identifiera mutationer och att uppskatta mängden mRNA, proteiner och gener.
• Beskriva och tillämpa algoritmer för att utforska och visualisera hög-dimensionell data.
• Beskriva och tillämpa metoder för att identifiera biologiska effekter i data från storskalig DNA-sekvensering.
• Beskriva och tillämpa metoder för att utvärdera statistisk signifikans i hög-dimensionell data.
• Förklara och kritiskt diskutera  i) kvantitativitet, ii) "the curse of dimensionality" samt iii) korrelation och kausalitet i relation till storskalig molekylärbiologisk data.

Kursinnehållet omfattar metoder för storskalig sekvensering, tillvägagångssätt för analys av sekvensdata samt deras tillämpningar, algoritmer för utforskande analys och visualisering av hög-dimensionell data samt statistiska metoder för att utvärdera biologiska effekter i hög-dimensionell data. Utmaningarna kopplade till analys av storskalig data inom livsvetenskaperna kommer även att diskuteras.