![Syntetisk transkriptionskontrollsmaskineri uttryckt i svampar.](/_next/image/?url=https%3A%2F%2Fcms.www.chalmers.se%2FMedia%2Fqx3doksa%2Fyvonne_nygard_figure-2_1920x1080px.jpg%3Frxy%3D0.49999958860467875%252C0.5028806039577312%26width%3D1920%26height%3D1080%26v%3D1d90f007f3e0d50%26quality%3D60%26format%3Dwebp&w=3840&q=90)
Det övergripande syftet med vår forskning är att påskynda design-build-test-learn cykeln, konceptet vi använder för att tillverka nya eller förbättrade cellfabriker som kan omvandla lignocellulosabiomassa (industriella sidoströmmar som kommer från restmaterial av växter) − eller sockerarter − till plattforms- eller precisionskemikalier. Exempel på produkter vi har som mål att tillverka är mjölksyra, aromatiska kemikalier och mycoprotein. Vi arbetar också med att förbättra toleransen mot inhibitorer i lignocellulosahydrolysat och med samtida användning av olika kolkällor.
![Översikt över jästcellers svar på ättiksyrastress baserat på CRISPRi transkriptionsreglering av essentiella gener. Översikt över jästcellers svar på ättiksyrastress baserat på CRISPRi transkriptionsreglering av essentiella gener.](/_next/image/?url=https%3A%2F%2Fcms.www.chalmers.se%2FMedia%2Fut0duhbr%2Fyvonnenygard_picture1_1080x1920px.jpg%3Fwidth%3D600%26height%3D800%26v%3D1d90ed5e6350e80%26quality%3D60%26format%3Dwebp&w=3840&q=90)
Cellfabriksdesign och stamutveckling
Vi arbetar främst med jäst och filamentösa svampar och använder industriella stammar då vi vill tillhandahålla lösningar som kan fungera och ge resultat även i stor skala. Vi använder både klassisk stamförbättring (adaptiv evolution och mutagenes) och genteknik för att omvandla mikroorganismerna till mer produktiva, robusta och inhibitortoleranta produktionsvärdar.
CRISPR/Cas9-baserad genomredigering och reglering av transkription
Vi utvecklar genomediterings- och transkriptionsregleringsverktyg baserade på CRISPR/Cas9-teknologin och syntetiska transkriptionsfaktorer. För att konstruera filamentösa svampar använder vi vanligtvis Cas9-ribonukleopartiklar, då vi kan förändra genomet utan att behöva utveckla nya genetiska verktyg anpassade för specifika arter, vilket påskyndar utvecklingen av nya stammar. För jäst har vi skapat en CRISPRa/i-verktygslåda som gör det möjligt att skapa och utvärdera stora mängder av stamvarianter.
Biosensorer och high-throughput screening
Vi arbetar med stora stambibliotek, såsom CRISPRi-samlingar som vi screenar under varierande förhållanden, i high-throughput. Vi har utvecklat screeningmetoder som gör det möjligt att utvärdera tillväxt direkt i relevant biomassa, vilket möjliggör utvecklingen av cellfabriker för industriell tillämpning. Ett annat forskningstema är att utveckla och använda biosensorer för screening och stamutvecklingsändamål.
Publikationer
Gruppmedlemmar
Forskningsledare
Doktorand
Alumner
- Changshuo Liu (besökande doktorand 2022)
- Amanda Grace Vaz (industripostdok 2021-2022)
- Emil Martinsson Budillon (masterstudent och projektassistent 2022)
- Darshan Balachandran (masterstudent 2022)
- Jelmar de Vries (student, kandidat och projektassistent 2022)
- Arne Peetermans (doktorand 2021-2022)
- Vaskar Mukherjee (postdok 2018-2022)
- Elena Camara (postdok 2017-2021)
- Pawel Piatek (postdok, 2017-2021)
- Tove Widén (projektassistant 2020)
- Luca Torello Pianale (masterstudent 2018-2019)
- Ibai Lenitz (masterstudent 2018-2019)
- Margarete Saraiva (postdok 2017-2018)
- Ignis Trollmann (masterstudent 2017-2018).